Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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