Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1Q04750 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1Q04750 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1Q04750 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms