Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Msx2Q03358 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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Msx2Q03358 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
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Msx2Q03358 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Msx2Q03358 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Msx2Q03358 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Msx2Q03358 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Msx2Q03358 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Msx2Q03358 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Msx2Q03358 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Msx2Q03358 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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