Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Muc1Q02496 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Muc1Q02496 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms