Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VldlrP98156 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VldlrP98156 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VldlrP98156 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VldlrP98156 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VldlrP98156 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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VldlrP98156 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VldlrP98156 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VldlrP98156 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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