Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra1P97785 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms