Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms