Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms