Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms