Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms