Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp3P63024 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms