Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps11P62281 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps11P62281 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps11P62281 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms