Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx1bP61264 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx1bP61264 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx1bP61264 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx1bP61264 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx1bP61264 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx1bP61264 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx1bP61264 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx1bP61264 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx1bP61264 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx1bP61264 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx1bP61264 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx1bP61264 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx1bP61264 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx1bP61264 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx1bP61264 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx1bP61264 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx1bP61264 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx1bP61264 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx1bP61264 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx1bP61264 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx1bP61264 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx1bP61264 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx1bP61264 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx1bP61264 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx1bP61264 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx1bP61264 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx1bP61264 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx1bP61264 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx1bP61264 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx1bP61264 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx1bP61264 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx1bP61264 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stx1bP61264 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx1bP61264 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx1bP61264 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx1bP61264 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx1bP61264 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx1bP61264 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx1bP61264 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx1bP61264 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx1bP61264 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx1bP61264 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx1bP61264 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx1bP61264 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx1bP61264 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx1bP61264 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx1bP61264 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx1bP61264 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx1bP61264 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx1bP61264 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx1bP61264 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stx1bP61264 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stx1bP61264 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx1bP61264 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx1bP61264 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx1bP61264 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms