Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uchl4P58321 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms