Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms