Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbp3P49194 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms