Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epb41P48193 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Epb41P48193 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epb41P48193 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Epb41P48193 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Epb41P48193 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Epb41P48193 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Epb41P48193 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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