Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp4P35123 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp4P35123 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp4P35123 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp4P35123 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp4P35123 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp4P35123 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp4P35123 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp4P35123 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp4P35123 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp4P35123 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp4P35123 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp4P35123 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp4P35123 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp4P35123 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp4P35123 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp4P35123 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp4P35123 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp4P35123 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp4P35123 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp4P35123 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp4P35123 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp4P35123 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp4P35123 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp4P35123 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp4P35123 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms