Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc3P33622 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc3P33622 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms