Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Saa4P31532 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Saa4P31532 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Saa4P31532 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Saa4P31532 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms