Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx2P31316 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms