Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp2P29594 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp2P29594 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp2P29594 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms