Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms