Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms