Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms