Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms