Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim30aP15533 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim30aP15533 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim30aP15533 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim30aP15533 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim30aP15533 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim30aP15533 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim30aP15533 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim30aP15533 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim30aP15533 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim30aP15533 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim30aP15533 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms