Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd44P15379 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd44P15379 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd44P15379 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd44P15379 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd44P15379 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd44P15379 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd44P15379 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd44P15379 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd44P15379 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms