Protein–RNA interactions for Protein: P14097

Ccl4, C-C motif chemokine 4, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl4P14097 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl4P14097 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms