Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01644 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01644 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01644 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01644 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01644 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01644 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01644 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01644 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01644 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01644 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01644 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01644 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01644 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01644 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01644 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01644 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01644 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01644 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01644 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01644 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01644 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01644 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01644 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01644 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01644 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01644 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01644 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01644 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01644 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01644 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01644 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01644 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01644 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01644 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01644 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01644 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01644 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01644 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01644 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01644 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01644 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01644 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01644 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01644 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01644 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01644 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01644 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01644 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01644 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01644 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01644 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01644 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01644 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01644 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01644 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01644 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01644 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01644 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01644 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01644 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01644 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01644 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01644 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01644 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01644 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01644 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01644 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01644 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms