Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cops6O88545 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cops6O88545 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cops6O88545 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cops6O88545 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cops6O88545 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops6O88545 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops6O88545 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops6O88545 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops6O88545 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops6O88545 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops6O88545 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cops6O88545 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cops6O88545 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cops6O88545 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cops6O88545 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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