Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CntfrO88507 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CntfrO88507 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CntfrO88507 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CntfrO88507 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CntfrO88507 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CntfrO88507 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms