Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dync1i1O88485 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms