Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek2O35942 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek2O35942 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms