Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaxO35602 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaxO35602 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaxO35602 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaxO35602 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaxO35602 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaxO35602 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaxO35602 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaxO35602 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaxO35602 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaxO35602 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaxO35602 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaxO35602 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaxO35602 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaxO35602 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaxO35602 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaxO35602 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaxO35602 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaxO35602 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaxO35602 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaxO35602 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaxO35602 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaxO35602 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaxO35602 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaxO35602 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaxO35602 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaxO35602 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RaxO35602 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaxO35602 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaxO35602 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaxO35602 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaxO35602 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaxO35602 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaxO35602 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaxO35602 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaxO35602 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaxO35602 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaxO35602 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaxO35602 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RaxO35602 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaxO35602 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaxO35602 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaxO35602 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaxO35602 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RaxO35602 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaxO35602 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaxO35602 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaxO35602 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaxO35602 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaxO35602 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RaxO35602 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RaxO35602 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RaxO35602 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RaxO35602 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RaxO35602 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RaxO35602 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RaxO35602 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RaxO35602 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RaxO35602 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RaxO35602 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RaxO35602 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RaxO35602 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RaxO35602 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RaxO35602 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms