Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NmiO35309 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NmiO35309 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NmiO35309 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NmiO35309 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NmiO35309 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NmiO35309 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NmiO35309 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NmiO35309 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NmiO35309 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NmiO35309 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NmiO35309 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NmiO35309 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NmiO35309 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NmiO35309 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NmiO35309 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NmiO35309 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NmiO35309 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NmiO35309 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NmiO35309 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NmiO35309 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NmiO35309 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NmiO35309 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NmiO35309 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NmiO35309 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NmiO35309 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NmiO35309 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NmiO35309 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NmiO35309 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NmiO35309 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NmiO35309 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NmiO35309 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NmiO35309 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NmiO35309 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NmiO35309 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NmiO35309 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NmiO35309 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NmiO35309 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NmiO35309 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NmiO35309 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NmiO35309 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NmiO35309 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NmiO35309 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NmiO35309 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NmiO35309 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NmiO35309 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NmiO35309 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NmiO35309 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NmiO35309 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NmiO35309 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NmiO35309 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NmiO35309 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NmiO35309 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NmiO35309 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NmiO35309 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NmiO35309 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NmiO35309 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NmiO35309 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NmiO35309 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NmiO35309 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NmiO35309 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NmiO35309 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NmiO35309 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NmiO35309 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NmiO35309 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NmiO35309 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NmiO35309 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NmiO35309 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NmiO35309 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NmiO35309 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NmiO35309 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NmiO35309 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NmiO35309 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NmiO35309 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NmiO35309 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NmiO35309 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NmiO35309 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NmiO35309 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NmiO35309 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NmiO35309 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NmiO35309 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NmiO35309 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NmiO35309 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NmiO35309 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NmiO35309 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NmiO35309 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NmiO35309 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NmiO35309 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NmiO35309 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NmiO35309 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NmiO35309 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NmiO35309 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NmiO35309 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NmiO35309 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NmiO35309 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NmiO35309 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NmiO35309 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NmiO35309 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NmiO35309 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NmiO35309 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms