Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms