Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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