Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Taf4bG5E8Z2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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Taf4bG5E8Z2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms