Protein–RNA interactions for Protein: F6XJP7

Pcsk6, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 6, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk6F6XJP7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pcsk6F6XJP7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pcsk6F6XJP7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pcsk6F6XJP7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk6F6XJP7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms