Protein–RNA interactions for Protein: E9Q007

Gm4450, Predicted gene 4450, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4450E9Q007 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms