Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms