Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms