Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad1D3YYZ1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms