Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms