Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CatipB9EKE5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CatipB9EKE5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CatipB9EKE5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms