Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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