Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pnldc1B2RXZ1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms