Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpb1B2RS76 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cpb1B2RS76 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cpb1B2RS76 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cpb1B2RS76 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cpb1B2RS76 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Cpb1B2RS76 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpb1B2RS76 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpb1B2RS76 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpb1B2RS76 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpb1B2RS76 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpb1B2RS76 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpb1B2RS76 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpb1B2RS76 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpb1B2RS76 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpb1B2RS76 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms