Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms